海啸造成邻海的函馆市在JR函馆车站一带和金森仓库区域淹水，也对函馆的观光产业造成直接的破坏和影响。而根据函馆市观光推进部传回的最新消息，目前朝市和金森仓库的海水都已退去，在当地努力下，金森仓库已在17日整理完成，恢复营业，朝市也在19日复原，部分歇业店家陆续重新开业。而沿海区以外的主要观光景点，除了JR函馆车站旁的“青函连络船记念馆 摩周丸”尚在休业中，元町十字街一带的主要观光设施包括博物馆、洋馆建筑物和看夜景的函馆山缆车，都未受波及，目前依然照常营运。住宿部分根据函馆旅馆协同组合的说明，住宿预约也已恢复正常。

在联外交通部分，目前由札幌前往函馆的高速巴士仍有运行，但另一个自由行旅客常利用的交通工具──JR，则因为部分列车和轨道泡水，虽仍有列车往来，但在往札幌、江差和长万部方面都有部分停驶。由东京往函馆方面的寝台列车损害较大，目前无法确知能够恢复通车的时间。