由进化到合体《数码宝贝故事：超组合战争》

　　登场人物

　　游戏沿用了动画的剧情，所以登场人物也是动画中的角色。动画中总共有四方势力，这里只做简单介绍。

　　Xros Heart(红军)

　　工藤新一，啊不，工藤太基，也不对，是工藤大器：本作男主人公，14岁，国立中学一年级生。性格正直，别人一有困难就会马上去帮人的老好人，有老实人且爱帮助别人的性格，体格强韧，过去一直是社团救兵，有着「怎么可以置之不理!」的口头禅，经常为了帮助他人而累垮。运动神经非常好。因为高吼兽的求救声而来到数码世界，顺便把当时他的两位朋友明里跟剑善次郎也一起卷进数码世界。拥有红色的Xros Loader，是Xros Heart 的指挥官。(工藤新一是吐槽他的声优，太基则是吐槽他带着一大堆数码兽到处搞激情……)

　　高吼兽 SHOUTMON：大器的最重要数码宝贝伙伴，Digi Xross的核心。小龙型数码宝贝，有着跟大器一样爱帮助别人的性格，看见别人遇到困难不会坐视不管，在困难面前决不会屈服。必杀技：摇滚之魂、灵魂粉碎波、摇滚劲歌手。

　　斯帕达兽 SUPADAMON：游戏原创数码宝贝。为自己选定的主人变身为巨大的武器，被称为“天使持有可以拯救世界，恶魔持有可以毁灭世界”的“武器数码宝贝”的幸存者。是最后的，也是最强的武器数码宝贝。持有“疲劳时糖分补给”的强迫观念?怪不得在动画里的Sweet Zone里出现- -。变成武器的时候实力很强(貌似，囧)，作为数码宝贝战斗力较弱。可以与主角合体为高吼兽X4S。

　　Blue Flare(蓝军)

　　苍沼切羽：与工藤大器同为中学一年级生，在学校莫名地进入了异世界。他凭借自己在整个数码世界中十分出色的军事才能以及强大的属下，使多数的数码兽向其折服。因为看见工藤大器的力量，曾一度引诱其成为自己的部下。拥有蓝色的Xros Loader，是Blue Flare的指挥官。

　　Twilight(黑军)

　　天野音音：率领着黑暗军团的少女。喜欢强大的男生，拥有黑色的Xros Loader，是Twilight 的指挥官。在第十九集、二十一集得知，暗黑骑士兽将她弟弟悠作为人质以胁迫音音帮助其积攒黑暗力量，音音因想和弟弟一起回到人类世界而和暗黑骑士兽合作。(在第24集中Xros Loader变为浅紫色)

　　Bagra(巴古拉军)

　　疯狂狮子兽、策略兽、爆风兽。